Федеральная служба по надзору в сфере транспорта привлекла ФБУ «Служба морской безопасности» в качестве Экспертного органа для проведения необходимых экспертиз, анализов и оценок состояния безопасности и охраны объектов морского и внутреннего водного транспортного комплекса.
ФБУ «Служба морской безопасности» аккредитовано Федеральным агентством морского и речного транспорта в качестве специализированной организации на проведение оценки уязвимости объектов транспортной инфраструктуры и транспортных средств в сфере морского и внутреннего водного транспорта. Свидетельство продлено до 09 августа 2019 года.